為賡續改善懷愛館設施老舊及因應本市人口老化而增加的未來治喪需求，繼一期整建工程於105年底完工啟用，接續進行二期整建計畫(105年 - 112年)。
二期整建工程規劃新建地下4層、地上5層殯儀禮廳大樓1棟，並整治排水、道路、景觀，已於108年9月10開工，總樓地板面積為35,227.46 m2。
(一)各樓層主要空間規劃如次：
1.地下肆層-汽車停車位131格、機房。
2.地下参層-汽車停車位123格、機房。
3.地下貳層-遺體冷凍櫃588屜，汽車停車位63格、機房。
4.地下壹層-機車停車位385格、汽車停車位73格、機房。
5.地上壹層-甲級廳1間(288席座位)、乙級禮廳4間(96席座位/間)、法醫解剖室1間、遺體冷凍櫃49屜。
6.地上貳層-丙級禮廳4間(60席座位/間)。
7.地上参層-丁級禮廳4間(24席座位/間)、拜飯區室1間。
8.地上肆層-丁級禮廳4間(24席座位/間)、多功能室1間。
9.地上伍層-多功能使用室1間。
(二)預期成效如次：
1.戶外景觀公園化，降低懷愛館鄰避感。
2.禮廳數量增加，滿足旺日時舉行告別式的治喪需求。
3.殯儀設施立體化，便利民眾洽辦治喪事宜。
4.停車空間地下化，改善館區內人車交織情形。